在申请分居长达两年以上的离婚程序时，需要提交如下的证明文件：租赁协议副本、当地居民委员会或者物业管理部门所开具的实际居住证明，用于证实在此期间双方当事人确实存在分居生活的状况；同时还应当提供可以充分证明分居事件真实性的书面素材，例如双方之间互相往来的信件、电子邮件等。此外，证人证词也是极其重要的证据部分，诸如对于该事情有所了解的邻居、亲戚朋友等人的陈述都将被视为有效证据。最后，工作单位出具的工作地点证明也将作为辅助性证据，以进一步证实双方当事人因感情破裂而导致的长期分居事实。所有上述的证明材料务必保证能够明确阐述出双方因为情感问题而达到法定分居年限的事实。

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如果你已经分居两年想离婚的话，那么你得准备下面这几样东西：首先你必须要有租赁合同或者是住在哪里的证明，这样才能证明你们在分居期间到底住在哪儿了；其次你还得有一些书面证据来证明你们确实是因为感情不好分开住的，比如说两人之间的通信电子邮件之类的；再来就是让了解你们情况的人做个证人行不行？比如说你家隔壁的大妈朋友等等；最后你还可以找找看你上班的地方能不能给你开个证明啥的。总之这些东西都要能清楚地证明你们分开住满两年了才行。
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解析：
要是想在分居两年后离婚的话，你得准备好下面这几样东西：1.租房合同或者是小区里的住户证明，这样就能证明你们俩在分居这段时间里到底住在哪里；2.还有就是你们之间互相发过的短信、邮件之类的，只要能证明你们确实分开住了就行；3.如果有邻居、亲戚朋友什么的知道你们的情况，也可以请他们来作证；4.最后你还得让公司给你开个证明，说明你平时都是在哪儿上班的。这些证据都得能清楚明白地证明你们因为感情不好已经分居超过两年了才行。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

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